本来，以中医之术，双胞胎很容易被诊断出，但阿文所患疾病很是稀奇，田婆婆虽医术高明，却也没诊断出阿文所怀是一对双胞胎，独孤求败也就不知道阿文怀着的是两个孩子。
所以那女孩便永远的留在了那户农户家。十八岁时，那女孩嫁到了幽忧谷附近的一家山农家。结婚后，女孩夫妇一直未能要上孩子，直到那女孩到了近四十岁年纪时，才生下一个男婴。但生下男婴后还未到一年，便遭到了金兵的烧杀抢掠，全家被金兵杀害，只有这名男婴被王一叶救出。而这名男婴的身世也就永远无人知晓了。
独孤求败返回庙中，见阿文和出生的孩子皆已死亡，一度失魂落魄。一年后，独孤求败才恢复正常。独孤求败回想以前事情，感觉前往幽忧谷诛杀黄裳，实是不该。而自从得到手中的这把“紫薇软剑”后，却是一直遭受大悲而无一喜。那“紫薇软剑”本是一大恶人使用，那恶人用此宝剑杀人无数，独孤求败除掉那恶人后，便将宝剑留给自己使用。
之后，独孤求败将“紫薇软剑”丢弃在山谷，并在一旁注道：“紫薇软剑，三十岁前所用，误伤义不祥，乃弃之深谷。”
后来，江湖传言黄裳没有死，独孤求败便四处寻找黄裳，但终究未能找到。独孤求败回想黄裳武功，觉得自己“独孤求败”的名讳实是牵强，便在自己“独孤剑法”八招八式的基础上，又创造了一招“总诀式”，至此，闻名江湖的“独孤九剑”全部完成。
独孤求败又在江湖飘荡了几十年，最终隐居山林。在此期间，独孤求败曾几次前往幽忧谷，却怎又知道自己还有一系血脉就在附近。
黄裳在少林寺与王一叶谈心聊天，不觉已几日过去，黄裳渐渐发现自己已经变老。在洪崖山谷中，黄裳日夜思索武功，从未想过光阴流逝，所以在洪崖山谷待了四十年，还以为仅仅过去了三四年。这几日以来，黄裳与王一叶聊天，心中渐渐平静下来，知道了当年在忧幽谷围攻自己的仇人都已离世，黄裳才感到光阴似箭，岁月如梭。
独自一人时，黄裳想自己终究也会离世而去，但四十年练得的绝世神功若随自己归入尘土，终是不忍。黄裳思来想去，决定将自己练得的神功记录下来。
在王一叶斋房旁边的一间房子，黄裳提起笔，先写下了自己所创八套武功的武功秘笈。待黄裳要写《道德经》八十一章神功的秘笈时，黄裳心想：“圣人做《道德经》，将武功秘笈隐藏于内，其本意是使世人得立国修身之术，而非得武学之术。自己却是不能违背圣人之意。”黄裳想到此，便未将《道德经》八十一章神功的秘笈写下。
黄裳看自己所创的八套武功：“阴德天报掌”、“大鹏神功”、“浑天大法”、“大伏魔拳法”、“微明功”、“移魂大法”、“白骨爪”、“摧心掌”，每套武功都是威力无穷，但若以“浑天术”联承起来，威力更是巨大数倍。黄裳暗道：“将‘浑天术’蕴含于武功，自己却是费了不少心血，若不将此记下，实是遗憾。但将此记下，八套武功的威力又是太过巨大。”黄裳思想许久，想到普曜大师所赠的《楞伽经》，里面有梵文文字，黄裳暗道：“将‘浑天术’以梵文记载，其间包含一些佛学之理，岂不甚好？能通梵文又懂佛理之人必是非常之人，圣人作《道德经》时将武功秘笈隐含起来，或许便是此意。”黄裳想到此，便将各套武功之间的“浑天术”联承法门以梵文形式记录了下来。
完成之后，黄裳暗道：“此书已经完成，却是起何名字？”黄裳寻思片刻，道：“李宪伯伯曾说过，万物皆遵阴阳之理，所谓善之于恶、强之于弱、刚之于柔、智之于愚、难之于简，皆也阴阳之理也。对于行善，若人不知，则为阴，亦曰阴德；若人知之，则为阳，亦曰阳善。阴德，天报之，阳善，享世名。佛法曰：九九归真。此书名字就叫做《九阴真经》！”黄裳轻言道：“书名《九阴真经》，只是希望世人积善阴德，遵行侠义，不求天报人知，但求无悔于心！”
书目已定，黄裳返回前面，将“白骨爪”武功改名为“九阴白骨爪”。黄裳又将《九阴真经》分为上、下两卷，而那些联承武功的“浑天术”梵文语句，未放在真经最开始，也未放在最后，而是放在了上卷的最后一章。
此时，黄裳不禁又心生担忧，黄裳心道：“真经武功之高实在是令人惊叹，此经若是落入恶人手中，持之以横行天下，无人制他得住。”黄裳作此真经前便有这一担忧，此时这种担忧更加强烈，黄裳暗暗道：“必须将此经藏于一绝密之地。自己练功的洪崖山谷却是一个很好的藏经之地。”黄裳想到此，心中渐渐平静。
所有事情完成之后，黄裳写下了《九阴真经》的序言：
天之道，损有余而补不足，是故虚胜实，不足胜有余；地之道，兼六合而并八荒，是故聚胜散，大整胜只单；人之道，非常道，夫得道者，大可安邦立国，利及万民，小可修习武学，健体强身。圣人著经作文，云云千万卷耳，以《道德经》为首。今世人研习经文，得立国修身之术，易也；然得武学之术，非大智慧所不能也。圣人知世人皆贪，故先智慧而后武功，以此为之，圣人之所以为圣人也。
余潜习圣人之经，遍阅天下道家之书，得道之理，据理推之，得武学之术，撰而成书，名曰《九阴真经》。以此经修习武功，无论智愚，无论巧拙，皆能功力无穷，无敌天下。据经研习，气可吞吐宇宙，力可震撼山岳，动则如龙如虎，快则恍如电闪，稳若大磨磐石，柔似弱水纱绵；真经亦包含吐呐之学，技击之术，招数之法，据经习之，一人可敌万千人，一招可化万千招。余不才，然遍观武学之书，实无出其右者。
徽宗年间，魔教盛行，***纲常。余奉旨平剿。奈何魔教高手甚多，余倾力抗击，终究寡不敌众，身负重伤。余幸而逃脱，魔匪暴虐，可怜父母妻子残遭毒手。余藏身绝世之地，立誓雪此大仇。余铭记魔匪武功招数，日夜苦思破解之法，终于一日得破解之术。余思之，即若众魔匪复齐拥而上，余亦能战而胜之。
余踏出深山绝地，遍寻魔匪复仇。然令余惊异者，众魔匪皆已亡矣。余孚能料及：四十年已过哉！